NILUs styremedlemmer utvelges av en valgkomite. Valgkomiteen består av ett medlem fra Klima- og miljødepartementet, ett fra Forskningsrådet og ett fra næringslivet.
NILUs styre gjeldende fra 1. juli 2018:
Styreleder
Dagfinn Myhre, Telenor Research
Styremedlemmer
- Brit Lisa Skjelkvåle, Institutt for Geofag, UiO
- Jonas Vevatne, Statsbygg
- Camilla Røsjø, Nofima
- Per Morten Johansen, Omsorgsbygg Oslo KF
Ansatterepresentanter
- Hilde Thelle Uggerud
- Mona Johnsrud